Table 1 Type of investigated mitochondrial markers and haplogroup determination.
From: Mitochondrial haplogroup H1 is protective for ischemic stroke in Portuguese patients
Mitochondrial Polymorphism (SNP Type)* | |||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Haplogroup | m.709G>A (ncod) | m.1719G>A (ncod) | m.3010G>A (ncod) | m.3348A>G (syn) | m.4580G>A (syn) | m.5999T>C (syn) | m.7028C>T (syn) | m.7805G>A (p.V74I) | m.8251G>A (syn) | m.8701A>G (p.T59A) | m.9055G>A (p.A177T) | m.10398A>G (p.T114A) | m.10873T>C (syn) | m.11719G>A (syn) | m.12308A>G (ncod) | m.12705C>T (syn) | m.13368G>A (syn) | m.13617T>C (syn) | m.13708G>A (p.A458T) |
H | C | G | |||||||||||||||||
H1 | A | C | G | ||||||||||||||||
V | A | T | G | ||||||||||||||||
pre-HV/HV | G | T | G | ||||||||||||||||
J | G | G | A | A | C | A | |||||||||||||
J1b | G | A | G | A | A | C | A | ||||||||||||
T | A | A | A | C | A | ||||||||||||||
U | A | G | C | ||||||||||||||||
U4 | C | A | G | C | |||||||||||||||
U5 | A | G | C | C | |||||||||||||||
U6a | G | A | A | G | C | ||||||||||||||
K1 | A | G | G | ||||||||||||||||
I | G | A | A | A | G | T | T | ||||||||||||
X2b | G | A | G | A | A | T | T | A | |||||||||||
W | A | G | A | A | A | T | T | ||||||||||||
L | G | G | C | T | |||||||||||||||