CNV studies | Â | WES (epi4K)4,18 | |||
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No of case | This study | Mefford, et al[37] | Tiwari, et al[8] | Paciokowski, et al[7] | Epi4K Consortium & Epilepsy Phenome/Genome Project |
 | 47 | 44 | 13 | N/A (clinical case series from diagnostic lab) | infantile spasms ( n = 149) Lennox–Gastaut syndrome (n = 115). |
Pathogenic/Possible pathogenic CNV | 4 | 3 | 4 | 11 | 329 de novo mutation |
 | De novo: | De novo: | De novo: | De novo: | Mutations in more than one proband |
 | 17p13 115 kb del | Xp22 290 kb del | 15q11 4.8 Mb dup | 2p16.1 4.0 Mb del | SCN1A; STXBP1; GABRB3; |
 | 1q44 2.1 Mb del | 16p11. 2.5 Mb dup | 16p11.2 595 kb dela | 3p26.3 1.6 Mb dup | CDKL5; SCN8A; SCN2A; |
 | 2q23.1 4.1 Mb del | 3q11 1.64 Mb dup | Xp22.11 dela,b | 7q11.23 1.4 Mb del | ALG13; DNM1; HDAC4 |
 | 1q21 2.1 Mb dup |  |  | 14q12 3.3 Mb dup |  |
 |  |  | Inherited: | 14q32.3 317 kb dup | Other candidate genes: |
 |  |  | 2q32.3 421 kb del | 15q11-q13 5.3 Mb dup | CACN1A; CHD2; FLNA; |
 |  |  |  | 19q12 1.3 Mb del | GABRB1; GRIN1; GRIN2B; |
 |  |  |  | 20p13 1.9 Mb del | HNRNPU; IQSEC2; MTOR; |
 |  |  |  | 21q21 1.3 Mb dup | NEDD4L |
 |  |  |  | 21q21 1.3 Mb dup |  |
 |  |  |  | Xp22.2 435 kb dup |  |
 |  |  |  | Unknown |  |
 |  |  |  | 2q24.3 21.5 Mb dup |  |