Polymorphisms in IL36G gene are associated with plaque psoriasis

BMC Medical Genetics

Table 3 Results of allelic association analysis

SNP	Reference allele	Control RAF	BSA ≤ 10		BSA 11–30		BSA ≥ 31		PASI ≤10		PASI 11–20		PASI ≥21
SNP	Reference allele	Control RAF	RAF	P value	RAF	P value	RAF	P value	RAF	P value	RAF	P value	RAF	P value
rs28947205	T	0.021	0.041	0.0799	0.045	0.0243	0.041	0.0504	0.036	0.1314	0.034	0.1804	0.054	0.0032
rs12328178	G	0.013	0.033	0.0344	0.033	0.0246	0.039	0.0053	0.031	0.045	0.022	0.2429	0.051	3.0E-4
rs28947206	T	0.002	0.021	0.0023	0.028	2.0E-4	0.021	0.0018	0.021	0.0018	0.017	0.0075	0.031	7.38E-5
rs28947207	T	0.011	0.039	0.0038	0.047	3.0E-4	0.048	2.0E-4	0.038	0.0039	0.036	0.0060	0.060	8.64E-6
rs17042686	C	0.066	0.098	0.0834	0.062	0.8463	0.073	0.6552	0.095	0.0982	0.071	0.7567	0.061	0.7902
rs6707930	A	0.012	0.000	0.0539	0.005	0.2288	0.008	0.5211	0.002	0.1131	0.002	0.1145	0.009	0.6308
rs13410389	A	0.085	0.056	0.1455	0.096	0.5856	0.058	0.1116	0.071	0.4649	0.083	0.9044	0.060	0.1548
rs34216066	C	0.095	0.059	0.0642	0.073	0.2135	0.059	0.0262	0.054	0.0175	0.084	0.5635	0.056	0.0193
rs28947211	C	0.041	0.003	0.0011	0.013	0.0093	0.012	0.0047	0.008	0.0017	0.010	0.0047	0.013	0.0087
rs13392494	T	0.464	0.508	0.2753	0.500	0.3266	0.534	0.0452	0.519	0.1425	0.471	0.8657	0.549	0.0159
rs7584409	G	0.310	0.308	0.9415	0.317	0.8073	0.348	0.1793	0.295	0.6002	0.303	0.8179	0.377	0.0239

ISSN: 1471-2350