Skip to main content

Table 2 Results of allelic association analysis

From: Polymorphisms in IL36G gene are associated with plaque psoriasis

SNP

Reference allele

Control RAF

Plaque psoriasis

Early onset

Late onset

Familial

Sporadic

Spring-summer

Fall-winter

PsA+

Male

Female

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

RAF

P value

rs28947205

T

0.021

0.042

0.0197

0.039

0.0502

0.053

0.0086

0.036

0.112

0.047

0.0095

0.038

0.3414

0.040

0.037

0.035

0.2001

0.050

0.0417

0.033

0.5279

rs12328178

G

0.013

0.036

0.0064

0.035

0.0094

0.038

0.0124

0.034

0.0155

0.037

0.0071

0.038

0.094

0.035

0.0081

0.040

0.0098

0.042

0.0611

0.028

0.1299

rs28947206

T

0.002

0.023

6.0E-4

0.021

0.0014

0.030

1.0E-4

0.026

4.0E-4

0.021

0.0013

0.024

0.0036

0.020

0.0021

0.018

0.0069

0.026

0.0095

0.020

0.0548

rs28947207

T

0.011

0.045

2.0E-4

0.043

4.0E-4

0.053

1.0E-4

0.039

0.0019

0.050

7.09E-5

0.037

0.0594

0.042

5.0E-4

0.035

0.0137

0.049

0.0015

0.040

0.0945

rs17042686

C

0.066

0.076

0.4358

0.073

0.5793

0.085

0.2965

0.066

0.9968

0.083

0.2391

0.075

0.752

0.079

0.3278

0.101

0.0754

0.081

0.3216

0.069

0.9764

rs6707930

A

0.012

0.005

0.1014

0.003

0.0424

0.010

0.8038

0.007

0.4366

0.003

0.0577

0.000

0.3314

0.004

0.1099

0.007

0.5659

0.007

0.6401

0.002

0.013

rs13410389

A

0.085

0.071

0.3241

0.074

0.4436

0.064

0.3023

0.057

0.0852

0.084

0.9262

0.121

0.3308

0.071

0.3225

0.075

0.6474

0.063

0.0582

0.081

0.7473

rs34216066

C

0.095

0.064

0.0172

0.060

0.0104

0.075

0.3267

0.055

0.0114

0.071

0.1139

0.013

0.0148

0.062

0.0204

0.047

0.0171

0.080

0.238

0.044

4.0E-4

rs28947211

C

0.041

0.010

1.75E-5

0.008

1.58E-5

0.017

0.058

0.007

3.0E-4

0.013

0.0018

0.000

0.0627

0.010

6.83E-5

0.008

0.0095

0.012

0.0635

0.009

4.0E-4

rs13392494

T

0.464

0.515

0.0822

0.522

0.0568

0.492

0.4916

0.526

0.0668

0.507

0.1855

0.407

0.4282

0.511

0.1284

0.442

0.5997

0.540

0.1847

0.482

0.9231

rs7584409

G

0.310

0.328

0.4439

0.330

0.4223

0.323

0.7017

0.329

0.502

0.329

0.4687

0.300

0.8522

0.326

0.5148

0.324

0.6925

0.331

0.8454

0.326

0.6515

  1. RAF – reference allele frequency
  2. P values < 0.05 after 10,000 permutations are bolded