Skip to main content

Table 3 Allele and genotypes frequencies in TMD and control groups

From: Genetic polymorphisms in folate pathway enzymes, DRD4 and GSTM1 are related to temporomandibular disorder

GENE

REFERENCE

ALELLE

PATIENTS

CONTROLS

 

ODDS RATIOS

   

G1

G2

G3

A1/A2

G1

G2

G3

A1/A2

Χ2genotype

Allele

OD

95%CI

p

SHMT1

rs1979276

A/G

7 (0,10)

36 (0,49)

30 (0,41)

0,34/0,66

24 (0,20)

54 (0,45)

41 (0,34)

0,43/0,57

     
 

rs1979277

A/G

8 (0,11)

31 (0,44)

32 (0,45)

0,33/0,67

35 (0,34)

28 (0,27)

41 (0,39)

0,47/0,53

0,002

G

3,99

1,72-9,25

0,002

 

rs643333

A/C

3 (0,04)

32 (0,43)

39 (0,53)

0,26/0,74

10 (0,08)

47 (0,39)

64 (0,53)

0,28/0,72

ns

 

-

  
 

rs638416

C/G

19 (0,24)

39 (0,50)

20 (0,26)

0,49/0,51

12 (0,10)

50 (0,41)

60 (0,49)

0,30/0,70

0,001

C

2,80

1,51-5,21

0,013

 

rs3783

C/G

1 (0,01)

27 (0,36)

46 (0,62)

0,20/0,80

2 (0,02)

33 (0,28)

85 (0,71)

0,15/0,85

ns

 

-

  

TYMS

rs2853542

C/G

55 (0,73)

20 (0,27)

0 (0,00)

0,87/0,13

96 (0,76)

30 (0,24)

0 (0,00)

0,88/0,12

ns

 

-

  
 

rs34489327

DI

9 (0,13)

25 (0,35)

38 (0,53)

0,30/0,70

7 (0,08)

32 (0,34)

54 (0,58)

0,25/0,75

ns

 

-

  
 

rs34743033

2R3R

12 (0,17)

36 (0,50)

24 (0,33)

0,42/0,58

10 (0,12)

55 (0,64)

21 (0,24)

0,44/0,56

ns

 

-

  

TCN

rs9606756

A/G

57 (0,75)

16 (0,21)

3 (0,04)

0,86/0,14

85 (0,73)

30 (0,26)

1 (0,01)

0,86/0,14

ns

 

-

  
 

rs1801198

C/G

30 (0,38)

38 (0,49)

10 (0,13)

0,63/0,37

56 (0,46)

61 (0,50)

6 (0,05)

0,70/0,30

ns

 

-

  

MTHFR

rs1801131

A/C

44 (0,57)

25 (0,32)

8 (0,10)

0,73/0,27

64 (0,53)

47 (0,39)

10 (0,08)

0,72/0,28

ns

 

-

  
 

rs1801133

C/T

27 (0,35)

37 (0,48)

13 (0,17)

0,59/0,41

43 (0,34)

62 (0,49)

22 (0,17)

0,58/0,42

ns

 

-

  

CBS

rs5742905

C/T

0 (0,00)

12 (0,18)

54 (0,82)

0,09/0,91

2 (0,02)

27 (0,25)

81 (0,74)

0,14/0,86

ns

 

-

  
 

cbs844ins68

SL

59 (0,84)

11 (0,16)

0 (0,00)

0,92/0,08

68 (0,81)

14 (0,17)

2 (0,02)

0,89/0,11

ns

 

-

  

ABCB1

rs1045642

C/T

28 (0,36)

38 (0,49)

12 (0,15)

0,60/0,40

30 (0,24)

64 (0,51)

31 (0,25)

0,50/0,50

ns

 

-

  

ATIC

rs2372536

C/G

23 (0,49)

18 (0,38)

6 (0,13)

0,68/0,32

44 (0,43)

42 (0,41)

17 (0,17)

0,63/0,37

ns

 

-

  

BHMT

rs3733890

A/G

11 (0,15)

29 (0,40)

32 (0,44)

0,35/0,65

17 (0,14)

54 (0,45)

49 (0,41)

0,37/0,63

ns

 

-

  

DHFR

DHFR19del

-+

22 (0,31)

31 (0,43)

19 (0,26)

0,52/0,48

29 (0,31)

48 (0,52)

16 (0,17)

0,57/0,43

ns

 

-

  

GSTM1

GSTM1del

-

17 (0,23)

56 (0,77)

 

0,62/0,38

39 (0,40)

58 (0,60)

 

0,70/0,30

0,015

null

2,21

1,24-4,36

0,030

MTHFD1

rs2236225

C/T

7 (0,09)

47 (0,63)

21 (0,28)

0,41/0,59

28 (0,24)

70 (0,60)

18 (0,16)

0,54/0,46

0,011

T

3,09

1,27-7,50

0,016

MTR

rs1805087

A/G

55 (0,71)

20 (0,26)

2 (0,03)

0,84/0,16

80 (0,63)

42 (0,33)

4 (0,03)

0,80/0,20

ns

 

-

  

MTRR

rs1801394

A/G

28 (0,37)

37 (0,49)

11 (0,14)

0,61/0,39

29 (0,25)

54 (0,47)

33 (0,28)

0,48/0,52

0,046

A

2,35

1,10-5,00

 

RFC1

rs1051266

A/G

15 (0,20)

42 (0,55)

19 (0,25)

0,47/0,53

28 (0,23)

59 (0,49)

33 (0,28)

0,48/0,52

ns

 

-

  

ESR1

rs9340799

A/G

37 (0,48)

35 (0,45)

5 (0,06)

0,71

55 (0,43)

59 (0,46)

13 (0,10)

0,67/0,33

ns

 

-

  
 

rs2234693

C/T

13 (0,17)

44 (0,56)

21 (0,27)

0,45

32 (0,25)

60 (0,48)

34 (0,27)

0,49/0,51

ns

 

-

  

DRD4

drd448bptr

SL

50 (0,96)

2 (0,04)

0 (0,00)

0,98

69 (0,87)

7 (0,09)

3 (0,04)

0,92

0,039

L

3,12

0,76-17,2

0,161

SCL6A4

5-HTTLPR

SL

20 (0,43)

16 (0,35)

10 (0,22)

0,61

31 (0,40)

32 (0,41)

15 (0,19)

0,60

ns

 

-

  
  1. ns = no statistical difference