Skip to main content

Table 3 Allele and genotypes frequencies in TMD and control groups

From: Genetic polymorphisms in folate pathway enzymes, DRD4 and GSTM1 are related to temporomandibular disorder

GENE REFERENCE ALELLE PATIENTS CONTROLS   ODDS RATIOS
    G1 G2 G3 A1/A2 G1 G2 G3 A1/A2 Χ2genotype Allele OD 95%CI p
SHMT1 rs1979276 A/G 7 (0,10) 36 (0,49) 30 (0,41) 0,34/0,66 24 (0,20) 54 (0,45) 41 (0,34) 0,43/0,57      
  rs1979277 A/G 8 (0,11) 31 (0,44) 32 (0,45) 0,33/0,67 35 (0,34) 28 (0,27) 41 (0,39) 0,47/0,53 0,002 G 3,99 1,72-9,25 0,002
  rs643333 A/C 3 (0,04) 32 (0,43) 39 (0,53) 0,26/0,74 10 (0,08) 47 (0,39) 64 (0,53) 0,28/0,72 ns   -   
  rs638416 C/G 19 (0,24) 39 (0,50) 20 (0,26) 0,49/0,51 12 (0,10) 50 (0,41) 60 (0,49) 0,30/0,70 0,001 C 2,80 1,51-5,21 0,013
  rs3783 C/G 1 (0,01) 27 (0,36) 46 (0,62) 0,20/0,80 2 (0,02) 33 (0,28) 85 (0,71) 0,15/0,85 ns   -   
TYMS rs2853542 C/G 55 (0,73) 20 (0,27) 0 (0,00) 0,87/0,13 96 (0,76) 30 (0,24) 0 (0,00) 0,88/0,12 ns   -   
  rs34489327 DI 9 (0,13) 25 (0,35) 38 (0,53) 0,30/0,70 7 (0,08) 32 (0,34) 54 (0,58) 0,25/0,75 ns   -   
  rs34743033 2R3R 12 (0,17) 36 (0,50) 24 (0,33) 0,42/0,58 10 (0,12) 55 (0,64) 21 (0,24) 0,44/0,56 ns   -   
TCN rs9606756 A/G 57 (0,75) 16 (0,21) 3 (0,04) 0,86/0,14 85 (0,73) 30 (0,26) 1 (0,01) 0,86/0,14 ns   -   
  rs1801198 C/G 30 (0,38) 38 (0,49) 10 (0,13) 0,63/0,37 56 (0,46) 61 (0,50) 6 (0,05) 0,70/0,30 ns   -   
MTHFR rs1801131 A/C 44 (0,57) 25 (0,32) 8 (0,10) 0,73/0,27 64 (0,53) 47 (0,39) 10 (0,08) 0,72/0,28 ns   -   
  rs1801133 C/T 27 (0,35) 37 (0,48) 13 (0,17) 0,59/0,41 43 (0,34) 62 (0,49) 22 (0,17) 0,58/0,42 ns   -   
CBS rs5742905 C/T 0 (0,00) 12 (0,18) 54 (0,82) 0,09/0,91 2 (0,02) 27 (0,25) 81 (0,74) 0,14/0,86 ns   -   
  cbs844ins68 SL 59 (0,84) 11 (0,16) 0 (0,00) 0,92/0,08 68 (0,81) 14 (0,17) 2 (0,02) 0,89/0,11 ns   -   
ABCB1 rs1045642 C/T 28 (0,36) 38 (0,49) 12 (0,15) 0,60/0,40 30 (0,24) 64 (0,51) 31 (0,25) 0,50/0,50 ns   -   
ATIC rs2372536 C/G 23 (0,49) 18 (0,38) 6 (0,13) 0,68/0,32 44 (0,43) 42 (0,41) 17 (0,17) 0,63/0,37 ns   -   
BHMT rs3733890 A/G 11 (0,15) 29 (0,40) 32 (0,44) 0,35/0,65 17 (0,14) 54 (0,45) 49 (0,41) 0,37/0,63 ns   -   
DHFR DHFR19del -+ 22 (0,31) 31 (0,43) 19 (0,26) 0,52/0,48 29 (0,31) 48 (0,52) 16 (0,17) 0,57/0,43 ns   -   
GSTM1 GSTM1del - 17 (0,23) 56 (0,77)   0,62/0,38 39 (0,40) 58 (0,60)   0,70/0,30 0,015 null 2,21 1,24-4,36 0,030
MTHFD1 rs2236225 C/T 7 (0,09) 47 (0,63) 21 (0,28) 0,41/0,59 28 (0,24) 70 (0,60) 18 (0,16) 0,54/0,46 0,011 T 3,09 1,27-7,50 0,016
MTR rs1805087 A/G 55 (0,71) 20 (0,26) 2 (0,03) 0,84/0,16 80 (0,63) 42 (0,33) 4 (0,03) 0,80/0,20 ns   -   
MTRR rs1801394 A/G 28 (0,37) 37 (0,49) 11 (0,14) 0,61/0,39 29 (0,25) 54 (0,47) 33 (0,28) 0,48/0,52 0,046 A 2,35 1,10-5,00  
RFC1 rs1051266 A/G 15 (0,20) 42 (0,55) 19 (0,25) 0,47/0,53 28 (0,23) 59 (0,49) 33 (0,28) 0,48/0,52 ns   -   
ESR1 rs9340799 A/G 37 (0,48) 35 (0,45) 5 (0,06) 0,71 55 (0,43) 59 (0,46) 13 (0,10) 0,67/0,33 ns   -   
  rs2234693 C/T 13 (0,17) 44 (0,56) 21 (0,27) 0,45 32 (0,25) 60 (0,48) 34 (0,27) 0,49/0,51 ns   -   
DRD4 drd448bptr SL 50 (0,96) 2 (0,04) 0 (0,00) 0,98 69 (0,87) 7 (0,09) 3 (0,04) 0,92 0,039 L 3,12 0,76-17,2 0,161
SCL6A4 5-HTTLPR SL 20 (0,43) 16 (0,35) 10 (0,22) 0,61 31 (0,40) 32 (0,41) 15 (0,19) 0,60 ns   -   
  1. ns = no statistical difference