Trait | SNP1 | Chr1 | SNP2 | Chr2 | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 |  |  |  |  | Gamete | A-T | G-G | G-T | A-G |  |  |  |  |  |
 | rs4437278 | 4 | rs705169 | 10 | Frequency | 0.0785 | 0.413 | 0.434 | 0.0742 |  |  |  |  |  |
TC | Â | Â | Â | Â | Effect | 0.103 | 0.0195 | -0.0186 | -0.108 | Â | Â | Â | Â | Â |
 |  |  |  |  | Allele-genotype | A-GG | G-GT | A-TT | G-TT | A-GT | G-GG |  |  |  |
 | rs4738150 | 8 | rs16918936 | 9 | Frequency | 0.0015 | 0.0284 | 0.557 | 0.374 | 0.0387 | 0.001 |  |  |  |
 |  |  |  |  | Effect | 0.961 | 0.0917 | 0.00219 | -0.00313 | -0.0636 | -1.42 |  |  |  |
 |  |  |  |  | Gamete | A-C | G-T | G-C | A-T |  |  |  |  |  |
 | rs10476539 | 5 | rs2392885 | 8 | Frequency | 0.0538 | 0.593 | 0.226 | 0.127 |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | Effect | 0.15 | 0.0137 | -0.0359 | -0.0635 |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | Genotype-genotype | GT-GG | GG-AG | GT-AA | TT-AG | TT-AA | TT-GG | GT-AG | GG-AA | GG-GG |
 | rs4706271 | 6 | rs6581219 | 12 | Frequency | 0.0817 | 0.0887 | 0.161 | 0.169 | 0.112 | 0.0619 | 0.24 | 0.055 | 0.0298 |
 |  |  |  |  | Effect | 0.137 | 0.127 | 0.0694 | 0.066 | -0.0495 | -0.0908 | -0.0932 | -0.103 | -0.189 |
 |  |  |  |  | Gamete | G-G | T-A | G-A | T-G |  |  |  |  |  |
HDL-C | rs2787520 | 6 | rs7236739 | 18 | Frequency | 0.106 | 0.448 | 0.241 | 0.206 | Â | Â | Â | Â | Â |
 |  |  |  |  | Effect | 0.0946 | 0.0224 | -0.0416 | -0.0488 |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | Gamete | C-A | T-G | T-A | C-G |  |  |  |  |  |
 | rs2842169 | 10 | rs4756344 | 11 | Frequency | 0.0751 | 0.237 | 0.661 | 0.0272 |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | Effect | 0.0801 | 0.0253 | -0.00908 | -0.221 |  |  |  |  |  |
 |  |  |  |  | Genotype | CC-AG | CT-AA | CT-GG | TT-AG | TT-GG | TT-AA | CT-AG | CC-GG | CC-AA |
 | rs12596869 | 16 | rs6506699 | 18 | Frequency | 0.0501 | 0.103 | 0.115 | 0.208 | 0.131 | 0.115 | 0.215 | 0.0344 | 0.0279 |
 |  |  |  |  | Effect | 0.223 | 0.109 | 0.0979 | 0.0535 | -0.0433 | -0.0494 | -0.103 | -0.167 | -0.197 |