From: Genetic factors associated with patient-specific warfarin dose in ethnic Indonesians
Gene | SNP | Position relative to transcription start site | Allele | n | % | MAF | Genotype | n | % | P-Value HWE |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CYP2C9** | rs17847036 | 3259 | G | 265 | 98.15 | 0.9815 | GG | 130 | 96.30 | 0.8265 |
 |  |  | A | 5 | 1.85 | 0.0185 | GA | 5 | 3.70 |  |
 |  |  |  |  |  |  | AA | 0 | 0.00 |  |
 | Novel SNP | 3164 | G | 224 | 91.80 | 0.9180 | GG | 102 | 83.61 | 0.3240 |
 | Intron 2 |  | A | 20 | 8.20 | 0.0820 | GA | 20 | 16.39 |  |
 |  |  |  |  |  |  | AA | 0 | 0.00 |  |
 | rs9332120 | 3435 | T | 264 | 97.78 | 0.9778 | TT | 129 | 95.56 | 0.7917 |
 |  |  | C | 6 | 2.22 | 0.0222 | TC | 6 | 4.44 |  |
 |  |  |  |  |  |  | CC | 0 | 0.00 |  |
 | rs2860905 | 3880 | G | 224 | 91.80 | 0.9180 | GG | 104 | 85.25 | 0.1556 |
 |  |  | A | 20 | 8.20 | 0.0820 | GA | 16 | 13.11 |  |
 |  |  |  |  |  |  | AA | 2 | 1.64 |  |
 | rs28371675 | 3922 | C | 198 | 81.15 | 0.8115 | CC | 79 | 64.75 | 0.4291 |
 |  |  | T | 46 | 18.85 | 0.1885 | CT | 40 | 32.79 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 3 | 2.46 |  |
 | rs28371676 | 3948 | T | 234 | 95.90 | 0.9590 | TT | 112 | 91.80 | 0.6369 |
 |  |  | C | 10 | 4.10 | 0.0410 | TC | 10 | 8.20 |  |
 |  |  |  |  |  |  | CC | 0 | 0.00 |  |
 | rs28371677 | 4057 | A | 224 | 91.80 | 0.9180 | AA | 104 | 85.25 | 0.1556 |
 |  |  | G | 20 | 8.20 | 0.0820 | AG | 16 | 13.11 |  |
 |  |  |  |  |  |  | GG | 2 | 1.64 |  |
 | rs9332127 | 9056 | G | 234 | 95.90 | 0.9590 | GG | 112 | 91.80 | 0.6369 |
 | (CYP2C9C-65) |  | C | 10 | 4.10 | 0.0410 | GC | 10 | 8.20 |  |
 |  |  |  |  |  |  | CC | 0 | 0.00 |  |
 | rs9332129 | 10322 | A | 234 | 96.69 | 0.9630 | AA | 112 | 92.56 | 0.6696 |
 |  |  | G | 9 | 3.72 | 0.0370 | AG | 9 | 7.44 |  |
 |  |  |  |  |  |  | GG | 0 | 0.00 |  |
 | rs1057910 | 42625 | A | 235 | 96.31 | 0.9631 | AA | 113 | 92.62 | 0.6723 |
 | (CYP2C9*3) |  | C | 9 | 3.69 | 0.0369 | AC | 9 | 7.38 |  |
 |  |  |  |  |  |  | CC | 0 | 0.00 |  |
 | Novel SNP | 47635 | C | 240 | 98.36 | 0.9836 | CC | 118 | 96.72 | 0.8539 |
 | Intron 8 |  | T | 4 | 1.64 | 0.0164 | CT | 4 | 3.28 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 0 | 0.00 |  |
 | rs2298037 | 47650 | C | 199 | 81.56 | 0.8156 | CC | 79 | 64.75 | 0.1957 |
 |  |  | T | 45 | 18.44 | 0.1844 | CT | 41 | 33.61 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 2 | 1.64 |  |
 | rs9332238 | 50064 | G | 233 | 95.49 | 0.9549 | GG | 111 | 90.98 | 0.6020 |
 |  |  | A | 11 | 4.51 | 0.0451 | GA | 11 | 9.02 |  |
 |  |  |  |  |  |  | AA | 0 | 0.00 |  |
 | rs1934969 | 50067 | A | 173 | 70.90 | 0.7090 | AA | 60 | 49.18 | 0.5595 |
 |  |  | T | 71 | 29.10 | 0.2910 | AT | 53 | 43.44 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 9 | 7.38 |  |
 | rs1057911 | 50309 | A | 234 | 95.90 | 0.9590 | AA | 112 | 91.80 | 0.6369 |
 |  |  | T | 10 | 4.10 | 0.0410 | AT | 10 | 8.20 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 0 | 0.00 |  |
VKORC1 | rs9923231 | -1639 | A | 208 | 77.04 | 0.7704 | AA | 78 | 57.78 | 0.3027 |
 |  |  | G | 62 | 22.96 | 0.2296 | AG | 52 | 38.52 |  |
 |  |  |  |  |  |  | GG | 5 | 3.70 |  |
EPHX1 | rs4653436 | -2586 | G | 203 | 87.50 | 0.8750 | GG | 91 | 78.45 | 0.0633 |
 |  |  | A | 29 | 12.50 | 0.1250 | GA | 21 | 18.10 |  |
 |  |  |  |  |  |  | AA | 4 | 3.45 |  |
GGCX | rs12714145 | 1291 | C | 145 | 59.43 | 0.5943 | CC | 34 | 27.87 | 0.0006 |
 |  |  | T | 99 | 40.57 | 0.4057 | CT | 77 | 63.11 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 11 | 9.02 |  |
PROC | rs2069920 | 3643 | C | 140 | 57.38 | 0.5738 | CC | 36 | 29.51 | 0.1232 |
 |  |  | T | 104 | 42.62 | 0.4262 | CT | 68 | 55.74 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 18 | 14.75 |  |
PROC | rs1799808 | -141 | C | 99 | 40.57 | 0.4057 | CC | 15 | 12.30 | 0.0563 |
 |  |  | T | 145 | 59.43 | 0.5943 | CT | 69 | 56.56 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 38 | 31.15 |  |
PROC | rs1799809 | -128 | A | 141 | 57.79 | 0.7747 | AA | 72 | 59.02 | 0.3009 |
 |  |  | G | 41 | 16.80 | 0.2253 | AG | 46 | 37.70 |  |
 |  |  |  |  |  |  | GG | 4 | 3.28 |  |
CYP4F2 | rs2108622 | 18454 | C | 198 | 81.15 | 0.8115 | CC | 82 | 67.21 | 0.3248 |
 |  |  | T | 46 | 18.85 | 0.1885 | CT | 34 | 27.87 |  |
 |  |  |  |  |  |  | TT | 6 | 4.92 |  |